2025年度の国土交通省予算では、整備新幹線建設費に関して自治体負担などを含む経費として前年度比383億円増の2658億円を計上。西九州新幹線（武雄温泉―長崎）には、前年度比46億円増の110億円を充当する。城原川ダム事業（神埼市）は、前年度比4400万円増の12億8800万円を計上した。

　整備新幹線の建設費は、JR側が国側に支払う施設使用料（貸付料）などを充てた上で、残りの3分の2を国、3分の1を沿線自治体が負担する。国費は前年度と同じ804億円。